Saat ini Mahasiswa S2 IHPT sudah memiliki organisasi sendiri. Organisasi ini dibentuk pada tanggal 4 Agustus 2023, atas persetujuan seluruh mahasiswa aktif, baik regular maupun fast track. Seluruh mahasiswa sepakat untuk memberi nama organisasinya yaitu Himpunan Mahasiswa Magister Proteksi Tanaman (HMMPT-Unand). Berdasarkan pemungutan suara yang dilakukan; Anita Yuliana terpilih sebagai Ketua Pengurus Periode I, Rosiana Fadilah Hrp sebagai Sekretaris, dan Anisa Putri Harliana sebagai Bendahara. Struktur selengkapnya terlampir.