Laboratorium Mikrobiologi merupakan unit yang fokus pada studi mikroorganisme tanaman, khususnya bakteri yang berinteraksi dengan tanaman maupun virus tanaman. Laboratorium ini menjadi pusat kegiatan praktikum dan penelitian ilmiah terkait kesehatan tanaman dari aspek mikrobiologis.

Ketua Laboratorium: Dr. Zurai Resti, SP., M.Si.

Fasilitas Utama: Media kultur, inkubator, peralatan sterilisasi, serta ruang kerja khusus untuk isolasi dan identifikasi mikroba.

Fokus dan Target Kegiatan: Penelitian keanekaragaman dan interaksi mikroba-tanaman (baik patogen maupun antagonis), serta penyelenggaraan praktikum mikrobiologi untuk tingkat sarjana dan pascasarjana.